Sigue a Sora, Donald y Goofy en su búsqueda, tras los acontecimientos ocurridos en la primera entrega. La historia comienza en Twilight Town, una tranquila localidad situada entre el día y la noche. Juntos tendrán que hacer frente a innumerables peligros en mundos conocidos, y por conocer. El universo de Kingdom Hearts vuelve a unir los clásicos personajes y mundos de la factoría Disney con una original historia llena de nuevos personajes y ambientes renovados, creados por Square Enix.