El presidente de Nintendo América, Reggie Fils-Aime, fue preguntado acerca de los posibles problemas que pueda causar el uso prolongado de Nintendo 3DS, tales como náuseas o dolores de cabeza u ojos. Reggie contestó: "Nintendo 3DS no tiene comporta ningún problema de salud. Estamos trabajando con expertos y hemos realizado pruebas exhaustivas debido a que sólo queremos llevar al mercado los mejores productos". No obstante, matizó que hay un pequeño sector de la población que si les preocupa: "Vamos a recomendar que los niños muy pequeños no vean imágenes en 3DS. La razón es porque los músculos de los ojos de los más pequeños aún no están completamente formados". No obstante, no se trata de un caso especial con la consola de Nintendo, pues la industria del cine ya realiza este tipo de advertencias en sus películas en 3D e incluso la propia Nintendo ya advertía de estos problemas en su ya extinta Virtual Boy.

Este tipo de imágenes son las que se pretende evitar